Еколошки прихватљиве комплексне соли имају неколико потенцијалних примена у фармацеутској области. Прво, они се истражују као носиоци дроге. Еколошки прихватљиве комплексне соли могу бити дизајниране да инкапсулирају молекуле лека, користећи њихову комплексну структуру да стабилно инкапсулирају молекуле лека, чиме се постиже контролисано ослобађање лека. На пример, прилагођавањем начина комплексирања и структуре еколошки прихватљивих комплексних соли, они могу да ослобађају лекове у складу са условима животне средине у различитим деловима тела (као што су пХ вредност, концентрација ензима, итд.), побољшавајући циљање лека и ефикасност. Друго, они се истражују за примену у синтези лекова. Еколошки прихватљиве комплексне соли могу да учествују у реакцијама синтезе лекова као катализатори или реакциони интермедијери. Они могу поседовати јединствене електронске структуре и хемијске активности, промовишући специфичне хемијске реакције за синтезу нових једињења са потенцијалном фармацеутском вредношћу. Поред тога, они се истражују за примену у откривању дрога.
Еколошки прихватљиве комплексне соли могу бити подвргнуте специфичним реакцијама комплексирања са одређеним молекулима лека. Коришћење промена у физичко-хемијским особинама пре и после реакције (као што су промене боје, промене проводљивости, итд.) може се користити за развој високо осетљивих метода детекције лекова. На пример, на основу промене боје настале када се комплексне соли које су еколошки прихватљиве у комплексу са молекулима лека, може успоставити колориметријска метода за откривање садржаја лека. Овај метод је релативно еколошки прихватљив и има високу осетљивост. Такође може играти улогу у побољшању формулација лекова. Комбиновањем са еколошки прихватљивим комплексним солима, може побољшати растворљивост и стабилност лекова, чиме се развијају-квалитетне формулације лекова, као што су формулације са продуженим{7}}опуштањем и циљане формулације.
